Trzech muzyków założyło zespół w 2003 roku. Jako swego patrona obrali oni Andrzeja Panufnika (1914-1991), polskiego kompozytora i dyrygenta, który wyemigrował w latach 50-tych do Wielkiej Brytanii. Od czasu swego powstania zespół kształci się u prof. Gerrita Zitterbarta z ABEGG Trio, prof. Hatto Beyerle - założyciela i długoletniego altowiolisty Kwartetu Albana Berga, prof. Adama Kosteckiego (Trio im. A. Rubinsteina) oraz Marcina Sieniawskiego - wiolonczelisty Kwartetu im. Karola Szymanowskiego. Od 2005 roku trio studiuje na kierunku Soloklasse-Kammermusik w Hochschule für Musik und Theater Hannover.

Andrzej Panufnik Trio, będąc od roku 2005 członkiem prestiżowej European Chamber Music Academy (ECMA), ma możliwość pracować pod okiem takich indywidualności jak Shmuel Ashkenasi (Vermeer String Quartet), prof. Elmar Budde, Peter Cropper (Lindsay String Quartet), Eckart Heiligers (Trio Jean Paul), Erich Höbarth, Avedis Kouyoumdjian, Rainer Kußmaul, Martin Löhr (Trio Jean Paul), Johannes Meissl (Artis Quartett), Vladimir Mendelssohn, Christoph Richter, Ulf Schneider (Trio Jean Paul), Gábor Tákacs-Nagy i Gérard Wyss.

We wrześniu 2006 r. trio wzięło udział w Festiwalu Muzyki Kameralnej w Trondheim (Norwegia), podczas których miało okazję współpracować z Josephem Kalichsteinem i Larsem Andersem Tomterem. Pod okiem Davida Harringtona z Kronos String Quartet trio pracowało także nad utworami współczesnych twórców.

W roku 2005 trio zostało wyróżnione III nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Muzyki Kameralnej "Charles Hennen Concours" w Holandii, a w roku 2006 nagrodę "Märkischer Kulturkonferenz". Zespół koncertuje na terenie Europy - brał udział w festiwalach takich jak Musikfest Goslar (Niemcy), Braunschweig Classix (Niemcy), Kalkalpen Kammermusik Festival (Austria), Trondheim Kammermusikk Festival (Norwegia), czy Festival Pablo Casals Prades (Francja), jak również wystapił wraz z Filharmonią Gotha-Suhl i Märkischer Jugendorchester, wykonując koncert potrójny L. van Beethovena.